تعمل كلية العلوم الهندسية وفقاً لطبيعة الدراسة على تحقيق الأهداف العامة للجامعة المنصوص عليها في قانونها لسنة 1990 من خلال الأهداف الخاصة بالكلية (المبينة في النظم الأساسية للجامعة) التالية:
- تأهيل الطلاب لنيل درجة البكالوريوس في سائر فنون المعرفة الهندسية وفقاً للبرامج الدراسية بالكلية.
- إتاحة فرصة التعليم والبحث لنيل درجات عليا (ماجستير- دكتوراة) في مجالات التخصص بالكلية.
- إعداد الخريج المسلم المؤهل للمارسة العملية الهندسية بكفاءة و اقتدار.
- إحياء التراث الإسلامي في مجالات العلوم الهندسية تأكيدا لهوية الأمة وأصالتها.
- توسيع دائرة الوعي الهندسي في البلاد وتقديم النصح والإرشاد في سائر دوائر التخصص الهندسي، مع توظيف إمكانات الكلية لخدمة البلاد والعباد.
في الإطار العام للوسائل الواردة في قانون الجامعة لسنة 1990 تعمل كلية العلوم الهندسية على تحقيق أهدافها الخاصة (المبينة في النظم الأساسية للجامعة) عبر الوسائل التالية:
- تدريس المقررات العلمية وفقاً لمناهج الكلية المرسومة.
- الإستعانة بالمختبرات والمعامل في عملية توصيل وتحصيل العلوم بالكلية.
- كتابة البحوث العلمية في مجالات العلوم الهندسية وإصدار المجلات والنشرات التعريفية بأعمال الكلية.
- إقامة البرامج الخاصة والمعارض والمؤتمرات المهتمة بالتراث الإسلامي في مجالات التقنية والعلوم الهندسية.
- الاهتمام بالجمعيات العلمية وتوظيف مناشطها بما يخدم أهداف الكلية.
